Échantillonner
Réaliser un échantillonnage coordonné chez l’humain, chez l’animal et dans l’environnement, notamment dans l’eau.
Programme de recherche
Science
Quelles sont les principales sources d’exposition à Campylobacter, quelles voies de transmission contribuent le plus au risque d’infection et où les interventions peuvent-elles avoir le plus d’impact ?
Notre approche
De l’échantillonnage à la prévention
CCC associe une approche One Health, des enquêtes épidémiologiques de terrain, la génomique et la modélisation pour identifier les voies de transmission et orienter les stratégies de prévention.
Séquencer
Caractériser les isolats et les métagénomes pour étudier la diversité des populations bactériennes et les déterminants de l’antibiorésistance.
Attribuer
Combiner génomique comparative et méthodes d’apprentissage automatique pour attribuer les isolats humains à leurs sources probables.
Modéliser
Intégrer les données épidémiologiques, génomiques et contextuelles pour comparer les voies de transmission et les stratégies d’intervention.
Prévenir
Identifier les interventions les plus pertinentes selon les contextes, notamment celles ciblant l’eau, les réservoirs animaux et la vaccination.
Résultats attendus
Des données pour orienter l’action
Voies de transmission
Quelle est la contribution relative des voies humaines, animales et environnementales à l’exposition et à la maladie ?
Populations et réservoirs prioritaires
Quels réservoirs, lignées bactériennes et profils d’antibiorésistance sont les plus importants selon les contextes ?
Stratégies d’intervention
Quelles interventions, réalistes dans chaque contexte, sont les plus susceptibles de réduire la transmission ?
Méthodes et ressources
Des méthodes ouvertes et réutilisables
Les protocoles d’étude, procédures de laboratoire et ressources d’analyse sont partagés afin que les approches puissent être reproduites et adaptées dans les différents sites partenaires de CCC.